79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3610 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 149 aa  306  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  42.19 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  37.98 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  34.42 
 
 		 166 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  44.33 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  35.86 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  34.97 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  32.59 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  32.35 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  31.39 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  29.23 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 156 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.21 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  24.81 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  41.33 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10738  PaaI_thioesterase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04355)  33.75 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00650285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  31.45 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  31.25 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  32.99 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  26.24 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  39.44 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  25.64 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.59 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  34 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0759  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  26.73 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  36.14 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0297  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.59 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.18 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 		 216 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 		 141 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  32.94 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  42 
 
 		 193 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  33.78 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  27.5 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  31.76 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>