190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3220 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  32.86 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  32.06 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  28.57 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  28.17 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  30.84 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  32.65 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  35.92 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  33.86 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  29.01 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  31 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  31.31 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  32.98 
 
 		 176 aa  52  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  28.78 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  28.78 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  28.78 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  28.78 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  28.78 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  31.3 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  29.59 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  27.87 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  29.47 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  29.41 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  27.59 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  29.06 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  26.37 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  28.68 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  25.66 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  31.37 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  25.22 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  27.97 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  30.19 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  32.63 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  30.89 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  28.06 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  28.95 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  28.95 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  28.95 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 		 225 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  25.41 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  25.41 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  25.66 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  25.66 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  25.66 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  33.64 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  22.06 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  31.58 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.3 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  31.58 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>