103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0932 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  286  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 		 139 aa  174  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  56.74 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  54.35 
 
 		 139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  41.6 
 
 		 137 aa  103  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  41.6 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  29.51 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  28.95 
 
 		 143 aa  57  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  29.17 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  32.46 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  29.01 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  30.71 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  31.93 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  27.19 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  30.4 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  28.93 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  35.64 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  31.76 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  27.42 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  32.99 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 144 aa  48.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  29.29 
 
 		 161 aa  47.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  30.25 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  25.21 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  30.6 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  27.69 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  30.58 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  30.58 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  31.67 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  25.64 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  30.58 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  31.11 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  29.21 
 
 		 295 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  30.66 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32.22 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  30.58 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  30.58 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  30 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  30.58 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  30.58 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  30.58 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  30.58 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  30.58 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  24.37 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  24.37 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  27.78 
 
 		 319 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  31.46 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  27.97 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  28.74 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  29.59 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  34.57 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4159  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 133 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.588084  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  29.35 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>