294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2865 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  68.94 
 
 		 163 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  64.63 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  68.18 
 
 		 163 aa  187  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  62.04 
 
 		 140 aa  184  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  64.06 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  52.5 
 
 		 319 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  52.5 
 
 		 295 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  49.26 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  51.67 
 
 		 304 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  47.69 
 
 		 301 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  43.65 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  50 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  38.76 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  41.35 
 
 		 334 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  40.15 
 
 		 329 aa  108  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  38.58 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  39.1 
 
 		 169 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  36.69 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  38.28 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  38.28 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  40.6 
 
 		 332 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  38.28 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  38.36 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  40.3 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  39.39 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  38.35 
 
 		 335 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  36.69 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  37.59 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  37.59 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  37.59 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  37.59 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  41.84 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  36.09 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  43.22 
 
 		 162 aa  92.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  38.69 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  43.96 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  37.01 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  34.19 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  34.93 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  34.85 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  31.94 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  33.55 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  32.58 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  27.85 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  30.14 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  30.14 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  30.14 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  39.02 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  38.55 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  27.81 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  33.13 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  31.25 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  32.17 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  24.68 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  29.92 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  27.59 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  27.59 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11565  hypothetical protein  35.92 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  27.59 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  27.59 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  27.59 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  27.59 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  27.59 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  27.59 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  23.42 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  30.57 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  31.09 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  30.14 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  29.56 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  22.78 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  32.14 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  22.78 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  30.77 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  23.42 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  23.42 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  23.42 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  32.28 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>