124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3584 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 145 aa  296  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  73.94 
 
 		 158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  78.32 
 
 		 149 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  57.04 
 
 		 141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  61.42 
 
 		 137 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  37.33 
 
 		 166 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  38.19 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  37.14 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  37.89 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  32.46 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  27.08 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  32.61 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  33.33 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  33.67 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  32.97 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  37.63 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 		 157 aa  48.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  33.75 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  29.17 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.51 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.47 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  35.58 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  35.16 
 
 		 238 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  21.05 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  35.23 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  22.81 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  34.45 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  34.48 
 
 		 248 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.92 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  29.91 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  35.56 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 209 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  29.77 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  26.28 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  29.77 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  29.77 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  25.19 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  35.63 
 
 		 374 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  31 
 
 		 153 aa  43.5  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  32.26 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  39.51 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  31 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 		 187 aa  42.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  33.73 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  30.43 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  37.66 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  30.97 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  30.1 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  29.21 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  26.67 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  32.26 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  32.88 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  31.36 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  31.87 
 
 		 193 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  31.36 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  31.36 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  30.1 
 
 		 128 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  30.1 
 
 		 128 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 		 168 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.24 
 
 		 155 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  32.18 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  32.05 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>