75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1078 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 154 aa  323  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  77.92 
 
 		 156 aa  261  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  71.24 
 
 		 157 aa  236  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  57.89 
 
 		 166 aa  204  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  58.71 
 
 		 159 aa  201  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  61.69 
 
 		 159 aa  192  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  55.7 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  57.05 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  56.29 
 
 		 161 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  56.13 
 
 		 160 aa  169  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  46.71 
 
 		 165 aa  161  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  53.74 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  46.62 
 
 		 158 aa  148  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  51.35 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1093  hypothetical protein  61.6 
 
 		 104 aa  143  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.242255 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  89.06 
 
 		 200 aa  130  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  43.45 
 
 		 170 aa  130  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  47.65 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  46.31 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  40.74 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  40.74 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  39.26 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  38.52 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  36.81 
 
 		 157 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  36.03 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  27.86 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  31.4 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  27.46 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  27.14 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  32.99 
 
 		 225 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  32.99 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  27.12 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  24.41 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10240  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  40.82 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 		 223 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  25.52 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  22.83 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  28.48 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  29.52 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  26.72 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0196  thioesterase family protein  26.92 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  32.63 
 
 		 316 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1582  phenylacetic acid degradation-like protein  34.43 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000511967  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  29.13 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  24.62 
 
 		 179 aa  40.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>