More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2725 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  281  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  45 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  45 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  45 
 
 		 160 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  45.45 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  43.33 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  39.2 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  42.24 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  40.91 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  36.79 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  34.48 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  35.54 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  37.07 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  36.67 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  35.9 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  39.83 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  39.5 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  36.84 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  36.27 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  34.17 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.48 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  37.76 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  31.4 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  39.78 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  34.29 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  34.29 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2002  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  36.36 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  35.38 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  42.22 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  42.22 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  42.22 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  36.43 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  40.22 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  36.21 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  35.38 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  35.38 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  32.54 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  35.38 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  31.82 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.82 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  35.65 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  32.73 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  32.73 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  35.66 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  39.33 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  32.73 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  32.73 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  41.43 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  41.12 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  32.76 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  41.11 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  33.94 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  32.71 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  35.66 
 
 		 374 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  31.82 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  34.21 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  31.82 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  31.82 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  31.82 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  31.82 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  31.82 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  31.82 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>