238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0908 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  60.15 
 
 		 139 aa  163  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  59.54 
 
 		 139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  60 
 
 		 153 aa  163  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  58.02 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  58.78 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  51.88 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  55.64 
 
 		 143 aa  153  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  57.14 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  62.73 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  51.15 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  51.15 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  51.15 
 
 		 199 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  50.38 
 
 		 139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  51.54 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  38.97 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  38.97 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  38.97 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  38.24 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  37.3 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  38.46 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  36.29 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  29.23 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  31.75 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  35 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  36.21 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  28.44 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  29.32 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3484  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  36.63 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  27.05 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  26.89 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  29.46 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  32.2 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  30.08 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  35 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  31.06 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  30.08 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  26.72 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  26.72 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  36.89 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  26.72 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  32.56 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  25.86 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  25.86 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  25.86 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  28.24 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  25.86 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  25.86 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  25.86 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  30.08 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  29.32 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  27.97 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0944  hypothetical protein  28.16 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00659595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  33.33 
 
 		 127 aa  52  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  26.15 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  27.97 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 138 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0963  hypothetical protein  28.16 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000957659  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  29.32 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  29.32 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  26.96 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  26.96 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  29.75 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  29.32 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3355  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.402541  normal  0.270475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>