283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2200 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  84.17 
 
 		 139 aa  248  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  84.89 
 
 		 139 aa  248  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  60.31 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  55.71 
 
 		 143 aa  163  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  58.02 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  54.68 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  62.41 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  58.33 
 
 		 199 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  57.5 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  58.33 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  58.33 
 
 		 139 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  56 
 
 		 153 aa  133  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  46.21 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  41.38 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  37.93 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  28.99 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  30.83 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  30.83 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  36.89 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  33.91 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  29.73 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  28.47 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  27.74 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  27.74 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  27.74 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  27.74 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  27.01 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  27.74 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  28.47 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  28.47 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  28.47 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  28.47 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  28.47 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  27.74 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  30.22 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  28.99 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  26.95 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  25.74 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  25.9 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  35.65 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  26.09 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  26.09 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  26.36 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  26.36 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  26.36 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  26.36 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  26.36 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  26.36 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  26.36 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  26.36 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  26.36 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  27.27 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  30.83 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  27.82 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  28.06 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3092  phenylacetic acid degradation-related protein  26.98 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  27.13 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.06 
 
 		 156 aa  57  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.04 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  23.62 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  27.64 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  27.64 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3593  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.741645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3395  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.19 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>