More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3491 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 139 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  93.53 
 
 		 139 aa  268  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  84.17 
 
 		 139 aa  248  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  59.54 
 
 		 137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  56.83 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  55 
 
 		 143 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  58.78 
 
 		 139 aa  157  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  55.71 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  64.29 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  56.67 
 
 		 139 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  56.67 
 
 		 199 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  48.91 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  56.67 
 
 		 139 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  56 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  46.43 
 
 		 142 aa  119  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  43.1 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  41.28 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  31.16 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  31.16 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  35.65 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  26.09 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  35.65 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  29.71 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  28.57 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  29.2 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  27.83 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  29.55 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  28.47 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  28.47 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  28.47 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  28.47 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  25.74 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  27.74 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  24.35 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  28.99 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  31.75 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  28.47 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  27.54 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  29.55 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  29.13 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 176 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  35.65 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.03 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0963  hypothetical protein  30.1 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000957659  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.03 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0944  hypothetical protein  30.1 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00659595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.03 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  25.45 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  26.98 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.03 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  25.45 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  25.45 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  26.28 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.11 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  26.28 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  26.28 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  26.28 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  26.28 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  25.45 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  25.45 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  25.45 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  25.45 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  25.45 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  25.45 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 141 aa  57  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3092  phenylacetic acid degradation-related protein  24.68 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>