More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3441 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  83.33 
 
 		 160 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  80.3 
 
 		 132 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  78.03 
 
 		 132 aa  210  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  75 
 
 		 133 aa  201  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  57.02 
 
 		 131 aa  140  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  52.07 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  45 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  41.98 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  38.97 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  38.64 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  37.93 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  39.25 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  33.85 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  33.85 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  33.85 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  33.85 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  36.04 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11875  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0963448  normal  0.270095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2311  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  41.38 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2835  hypothetical protein  34.23 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2852  hypothetical protein  34.23 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2808  phenylacetic acid degradation-related protein  34.23 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  40.54 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  33.91 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  34.85 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3355  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.402541  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  34.85 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  32.82 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  31.9 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2759  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0533783  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 183 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3085  hypothetical protein  32.43 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  34.23 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  36.45 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  33.64 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  33.64 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  33.64 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  33.64 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  33.64 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  27.69 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  33.64 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  31.3 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  33.64 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  30.43 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  33.64 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  31.4 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  31.4 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  32.71 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  32.71 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  30.56 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  31.3 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.06 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  31.3 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12960  hypothetical protein  35.24 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.552344  normal  0.38168 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.23 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.66 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  30.77 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1474  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  34.55 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  31.45 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  34.71 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>