230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2852 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2808  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 
134 aa  273  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2852  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  273  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453308  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2835  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  273  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3085  hypothetical protein  83.58 
 
 
134 aa  238  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715187  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3355  thioesterase superfamily protein  81.82 
 
 
133 aa  229  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.402541  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11875  hypothetical protein  64.17 
 
 
140 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0963448  normal  0.270095 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2759  thioesterase superfamily protein  68.55 
 
 
169 aa  168  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0533783  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2311  thioesterase superfamily protein  67.5 
 
 
141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  57.36 
 
 
130 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  56.35 
 
 
129 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0870  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 
139 aa  107  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.222381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  45.79 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  40.57 
 
 
142 aa  84  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
135 aa  84  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  38.68 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  37.74 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  37.74 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  37.74 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  37.74 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  37.74 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  37.74 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  37.74 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  37.74 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  36.11 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1486  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  36.79 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3484  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  36.79 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  33.05 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0638  hypothetical protein  37.86 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  33.04 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0695  hypothetical protein  36.89 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0329769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0652  hypothetical protein  36.89 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0757  hypothetical protein  36.89 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0711  hypothetical protein  36.89 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276365  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  33.33 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  33.33 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3202  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  35.92 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  33.96 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  33.96 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  33.96 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0886  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  31.82 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  29.92 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  29.92 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  32.43 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  32.76 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  29.92 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  29.92 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  29.92 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00564  hypothetical protein  33.98 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3029  thioesterase superfamily protein  33.98 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.99639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00553  hypothetical protein  33.98 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  33.98 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  36.79 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  31.25 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  29.13 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  33.98 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0617  hypothetical protein  33.98 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3047  hypothetical protein  33.98 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0499  hypothetical protein  33.98 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0682  hypothetical protein  33.98 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1045  hypothetical protein  32.76 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  34.21 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  31.58 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12960  hypothetical protein  35.51 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.552344  normal  0.38168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  32.43 
 
 
160 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  31.9 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  31.93 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  31.53 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  31.58 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  32.69 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0015  aromatic compounds catabolism protein  33.62 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  29.13 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  32.08 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  32.08 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>