186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1083 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 132 aa  266  8.999999999999999e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  53.72 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  57.26 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  51.24 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  54.55 
 
 		 132 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  52.07 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  51.22 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  39.2 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  34.35 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  33.59 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  34.88 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  33.59 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  33.59 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  35.88 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  36.29 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  34.96 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  38.32 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  30.7 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  33.81 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  30.83 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  33.02 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  33.02 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2002  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1068  hypothetical protein  32.08 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0906  hypothetical protein  33.02 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1474  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  31.13 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  30.39 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3031  hypothetical protein  32.08 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.499419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0943  hypothetical protein  32.08 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.321033 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3593  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.741645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  30.19 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3092  phenylacetic acid degradation-related protein  33.02 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  28.68 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  34.62 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0892  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.915602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3395  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3470  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.743787  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  27.73 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0958  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 		 148 aa  50.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  29.91 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  26.89 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.71 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.979137 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  29.25 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  33.67 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2944  hypothetical protein  30.19 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  27.19 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  27.19 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  27.19 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  27.19 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  29.91 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  27.19 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3008  hypothetical protein  30.19 
 
 		 145 aa  48.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0246999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  27.27 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  27.86 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  26.81 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  27.19 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  27.19 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11875  hypothetical protein  28.7 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0963448  normal  0.270095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  28.78 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.17 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  27.19 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  28.43 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  26.42 
 
 		 172 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2808  phenylacetic acid degradation-related protein  30.7 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  26.32 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2835  hypothetical protein  30.7 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>