216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3582 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 
143 aa  299  7.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  78.87 
 
 
143 aa  240  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  63.31 
 
 
139 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  60 
 
 
139 aa  173  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  55.71 
 
 
139 aa  163  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  55 
 
 
139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  60.8 
 
 
153 aa  156  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  51.88 
 
 
137 aa  156  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  55.56 
 
 
139 aa  152  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  46.38 
 
 
199 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  48.92 
 
 
139 aa  135  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  46.38 
 
 
139 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  59.26 
 
 
141 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  46.38 
 
 
139 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  47.06 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  32.06 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  31.39 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  34.96 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  41.38 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  42.53 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  31.62 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  32.46 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  32.46 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  32.46 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  37.07 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  38.89 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  32.17 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  29.2 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  32.17 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  32.12 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  31.58 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  31.58 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  31.58 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  31.58 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  31.58 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  31.58 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  30.88 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  29.63 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  29.63 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  28.06 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  29.63 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  29.63 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  29.63 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  29.57 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  29.63 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  30.51 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  29.86 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  28.06 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  31.85 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  28.89 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  28.06 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  29.45 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  28.89 
 
 
136 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  39.08 
 
 
132 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  29.23 
 
 
141 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1486  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  29.32 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  29.93 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  29.55 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  28.68 
 
 
195 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20230  hypothetical protein  30.53 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00564  hypothetical protein  29.55 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  29.55 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  26.89 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  26.89 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3047  hypothetical protein  29.55 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  26.89 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>