267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3942 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  303  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  91.72 
 
 		 149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2944  hypothetical protein  88.97 
 
 		 145 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  87.59 
 
 		 145 aa  274  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3470  thioesterase superfamily protein  87.59 
 
 		 145 aa  273  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.743787  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3395  thioesterase superfamily protein  87.59 
 
 		 145 aa  273  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3593  thioesterase superfamily protein  87.59 
 
 		 145 aa  273  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.741645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0892  thioesterase superfamily protein  86.9 
 
 		 145 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.915602  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0906  hypothetical protein  86.21 
 
 		 145 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3031  hypothetical protein  85.52 
 
 		 145 aa  270  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.499419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0943  hypothetical protein  85.52 
 
 		 145 aa  270  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.321033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1068  hypothetical protein  84.83 
 
 		 145 aa  268  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3092  phenylacetic acid degradation-related protein  84.83 
 
 		 158 aa  268  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  86.21 
 
 		 145 aa  266  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  85.52 
 
 		 145 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3008  hypothetical protein  82.76 
 
 		 145 aa  263  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0246999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 		 150 aa  136  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  49.59 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  50.41 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  44.76 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  48.28 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  49.3 
 
 		 144 aa  133  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  41.38 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  41.38 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  48.78 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  45.14 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  47.18 
 
 		 195 aa  130  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  43.75 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  45.14 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  47.89 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  46.56 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  48.33 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  41.67 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  43.26 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  47.76 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  46.15 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  43.26 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  43.26 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  43.26 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  43.26 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  43.26 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  43.26 
 
 		 136 aa  124  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  40.56 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  40.56 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  42.55 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  41.67 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  41.96 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  42.55 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  40.97 
 
 		 140 aa  120  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  42.07 
 
 		 142 aa  120  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  39.86 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  45.08 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  45.76 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  46.61 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  46.61 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  45.76 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  45.76 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  46.09 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  47.46 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  41.84 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  41.84 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  41.84 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  43.9 
 
 		 141 aa  117  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  41.84 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  43.44 
 
 		 144 aa  116  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  44.92 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  44.92 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  44.92 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  41.84 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  44.92 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  44.92 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  43.45 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 147 aa  114  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  39.86 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  39.86 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  40.56 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  39.58 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  46.92 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  38.46 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  39.01 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 136 aa  110  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  41.46 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  44.19 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  48.76 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  39.84 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  39.01 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  42.24 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1486  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63041  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.503505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>