257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1515 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
148 aa  306  6.999999999999999e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  80.82 
 
 
149 aa  248  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  77.7 
 
 
151 aa  245  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  79.45 
 
 
146 aa  244  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  77.24 
 
 
150 aa  243  6e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  74.66 
 
 
147 aa  236  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  74.48 
 
 
172 aa  230  4.0000000000000004e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  51.7 
 
 
145 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  56.3 
 
 
149 aa  163  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  60 
 
 
141 aa  161  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  53.57 
 
 
145 aa  157  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  58.4 
 
 
144 aa  155  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  50 
 
 
146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  50 
 
 
157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  52.21 
 
 
139 aa  150  4e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  48.23 
 
 
141 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 
144 aa  147  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  55.83 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  54.26 
 
 
134 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  48.23 
 
 
142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1757  hypothetical protein  43.15 
 
 
144 aa  136  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  51.22 
 
 
145 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  56.78 
 
 
165 aa  136  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  52.34 
 
 
139 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  51.67 
 
 
150 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  55.56 
 
 
142 aa  134  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3092  phenylacetic acid degradation-related protein  50.41 
 
 
158 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3031  hypothetical protein  52.03 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.499419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0943  hypothetical protein  52.03 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.321033 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3395  thioesterase superfamily protein  51.22 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114226  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3593  thioesterase superfamily protein  51.22 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.741645  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3470  thioesterase superfamily protein  51.22 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.743787  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  53.91 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0906  hypothetical protein  52.03 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398679  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 
144 aa  131  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1068  hypothetical protein  51.22 
 
 
145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  53.04 
 
 
140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0892  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 
145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.915602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  53.91 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  53.91 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3008  hypothetical protein  50.41 
 
 
145 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0246999  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  48.55 
 
 
140 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2944  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  127  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  49.58 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  50.42 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  50.42 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  50.42 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  50.42 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  50.42 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  46.56 
 
 
145 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  47.14 
 
 
195 aa  127  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  49.58 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  50.42 
 
 
127 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  49.58 
 
 
127 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  49.58 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  47.29 
 
 
138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1045  hypothetical protein  47.58 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 
145 aa  124  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  48.74 
 
 
127 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  48.74 
 
 
147 aa  123  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  45.74 
 
 
139 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  41.73 
 
 
145 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  41.73 
 
 
145 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  46.38 
 
 
144 aa  121  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  44.44 
 
 
145 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 
127 aa  120  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  47.83 
 
 
142 aa  120  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  47.62 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  48.74 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 
140 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  51.43 
 
 
147 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  47.93 
 
 
136 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  47.93 
 
 
136 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  47.93 
 
 
136 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  47.93 
 
 
136 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  47.93 
 
 
136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  47.93 
 
 
136 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  47.93 
 
 
136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  42.14 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  42.14 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  42.14 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  47.93 
 
 
136 aa  117  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  45.22 
 
 
157 aa  116  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  47.06 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 
140 aa  115  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  45.9 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  47.11 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  44.07 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  41.73 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00564  hypothetical protein  42.45 
 
 
137 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3029  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 
137 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.99639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0499  hypothetical protein  42.45 
 
 
137 aa  113  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3047  hypothetical protein  42.45 
 
 
137 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  42.45 
 
 
137 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00553  hypothetical protein  42.45 
 
 
137 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  42.45 
 
 
137 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0617  hypothetical protein  42.45 
 
 
137 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  40.29 
 
 
138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>