265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2944 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2944  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  303  7e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  88.97 
 
 
149 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  88.97 
 
 
145 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0906  hypothetical protein  88.28 
 
 
145 aa  278  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398679  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3031  hypothetical protein  87.59 
 
 
145 aa  277  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.499419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0943  hypothetical protein  87.59 
 
 
145 aa  277  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.321033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1068  hypothetical protein  86.9 
 
 
145 aa  276  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  85.52 
 
 
145 aa  274  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3593  thioesterase superfamily protein  85.52 
 
 
145 aa  273  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.741645  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3395  thioesterase superfamily protein  85.52 
 
 
145 aa  273  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114226  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3470  thioesterase superfamily protein  85.52 
 
 
145 aa  273  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.743787  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3008  hypothetical protein  84.83 
 
 
145 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0246999  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0892  thioesterase superfamily protein  84.83 
 
 
145 aa  271  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.915602  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  84.83 
 
 
145 aa  268  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3092  phenylacetic acid degradation-related protein  82.07 
 
 
158 aa  264  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  83.45 
 
 
145 aa  261  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  46.48 
 
 
145 aa  147  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  47.92 
 
 
150 aa  140  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  47.22 
 
 
172 aa  140  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  45.45 
 
 
145 aa  139  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  53.66 
 
 
139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  52.89 
 
 
144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  49.66 
 
 
165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  52.85 
 
 
142 aa  137  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  47.92 
 
 
144 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  42.07 
 
 
146 aa  134  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  42.07 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  48.59 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  46.53 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  47.18 
 
 
195 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  45.14 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  50.82 
 
 
149 aa  130  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  47.46 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  46.15 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
148 aa  127  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  50.81 
 
 
134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  43.06 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  41.96 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  47.93 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  47.41 
 
 
139 aa  124  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  44.52 
 
 
140 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  46.28 
 
 
127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  46.28 
 
 
127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  41.26 
 
 
145 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  41.26 
 
 
145 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 
140 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  45.14 
 
 
151 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  45.45 
 
 
127 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  42.76 
 
 
142 aa  120  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  45.45 
 
 
127 aa  120  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  41.26 
 
 
147 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  47.11 
 
 
127 aa  120  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  43.2 
 
 
144 aa  120  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  45.9 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  43.36 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  44.63 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  44.63 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  44.63 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  44.63 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  44.63 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  44.63 
 
 
147 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  45.53 
 
 
141 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  41.84 
 
 
136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  44.63 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  41.84 
 
 
136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  41.84 
 
 
136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  41.84 
 
 
136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  41.84 
 
 
136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  41.84 
 
 
136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  41.84 
 
 
136 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  44.14 
 
 
141 aa  117  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  48.76 
 
 
139 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  40.56 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  41.13 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  41.13 
 
 
136 aa  114  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  39.58 
 
 
138 aa  114  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  41.84 
 
 
136 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  41.84 
 
 
136 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  41.84 
 
 
136 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  41.84 
 
 
136 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  41.84 
 
 
136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  44.96 
 
 
135 aa  111  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  46.28 
 
 
136 aa  110  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 
138 aa  110  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  40.65 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  37.76 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  38.19 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  37.76 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  42.74 
 
 
140 aa  108  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  49.18 
 
 
142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  44.17 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 
136 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 
138 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1757  hypothetical protein  36.96 
 
 
144 aa  104  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1486  thioesterase superfamily protein  38.19 
 
 
139 aa  104  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>