223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2216 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  100 
 
 		 147 aa  302  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  91.72 
 
 		 147 aa  279  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  72.79 
 
 		 147 aa  241  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  70.34 
 
 		 147 aa  226  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  73.38 
 
 		 145 aa  223  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  73.38 
 
 		 145 aa  223  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  52.52 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  54.29 
 
 		 144 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  54.68 
 
 		 144 aa  160  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  53.28 
 
 		 145 aa  156  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  55.07 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  54.74 
 
 		 141 aa  153  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  56.83 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  56.49 
 
 		 138 aa  150  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  52.94 
 
 		 136 aa  147  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  53.28 
 
 		 195 aa  147  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  52.21 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  52.21 
 
 		 136 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  52.21 
 
 		 136 aa  145  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  51.47 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  52.21 
 
 		 136 aa  145  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  52.21 
 
 		 136 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  52.21 
 
 		 136 aa  145  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  53.12 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  56 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  51.47 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  51.91 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  47.18 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  50.74 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  50.74 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  50.74 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  51.43 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  52.21 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  52.21 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  52.21 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  52.21 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  52.21 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  49.28 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  50.35 
 
 		 142 aa  139  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  52.24 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  52.55 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  48.53 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  48.55 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  48.91 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  46.38 
 
 		 157 aa  137  7e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 138 aa  136  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  46.38 
 
 		 146 aa  136  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  49.28 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  50.77 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  51.47 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  51.09 
 
 		 138 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  48.55 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  47.1 
 
 		 145 aa  131  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  57.69 
 
 		 172 aa  131  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  53.78 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  50.42 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  50.42 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  46.04 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  49.58 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  49.58 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  49.58 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  50.82 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  49.58 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  51.72 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  49.58 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  49.58 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  49.58 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  50.42 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1757  hypothetical protein  50.39 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  49.18 
 
 		 136 aa  126  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  51.75 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1486  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  47.93 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0711  hypothetical protein  45.59 
 
 		 137 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0695  hypothetical protein  45.59 
 
 		 137 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0329769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0652  hypothetical protein  45.59 
 
 		 137 aa  123  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0638  hypothetical protein  44.85 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  44.12 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  41.96 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3593  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.741645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  41.96 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3395  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3470  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.743787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0757  hypothetical protein  44.85 
 
 		 137 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2944  hypothetical protein  41.26 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  43.57 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  42.66 
 
 		 149 aa  120  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  44.12 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3031  hypothetical protein  41.26 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.499419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0943  hypothetical protein  41.26 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.321033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0906  hypothetical protein  41.96 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0499  hypothetical protein  44.12 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>