More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2101 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
135 aa  278  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  78.4 
 
 
136 aa  218  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  62.88 
 
 
138 aa  175  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  59.85 
 
 
142 aa  166  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  60.66 
 
 
127 aa  153  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  60.66 
 
 
127 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  60.66 
 
 
127 aa  151  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  62.6 
 
 
139 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  61.48 
 
 
127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  60.66 
 
 
127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  59.84 
 
 
127 aa  150  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  59.84 
 
 
127 aa  150  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  59.84 
 
 
127 aa  150  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  59.84 
 
 
127 aa  150  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  59.84 
 
 
127 aa  150  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  61.02 
 
 
127 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  56.92 
 
 
134 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  58.54 
 
 
142 aa  142  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  55.83 
 
 
124 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  51.16 
 
 
139 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  50.42 
 
 
165 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  47.69 
 
 
145 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  51.97 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  49.58 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  49.59 
 
 
195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  46.34 
 
 
147 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  49.57 
 
 
142 aa  120  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  48.31 
 
 
140 aa  120  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  48.31 
 
 
140 aa  120  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  43.61 
 
 
140 aa  120  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  47.06 
 
 
144 aa  120  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  48.03 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  48.33 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  43.2 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  47.06 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  50.43 
 
 
140 aa  117  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  46.15 
 
 
149 aa  116  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  44.19 
 
 
145 aa  116  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  44.19 
 
 
145 aa  116  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  44.26 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  45.45 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2965  hypothetical protein  53.45 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0165081  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 
147 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 
138 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  46.34 
 
 
138 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  46.34 
 
 
138 aa  115  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  48.36 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  45.31 
 
 
172 aa  114  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  44.62 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  44.19 
 
 
145 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  44.72 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  47.83 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  45.9 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1068  hypothetical protein  44.96 
 
 
145 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3092  phenylacetic acid degradation-related protein  46.88 
 
 
158 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3031  hypothetical protein  44.96 
 
 
145 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.499419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0943  hypothetical protein  44.96 
 
 
145 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.321033 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  43.85 
 
 
146 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2944  hypothetical protein  44.96 
 
 
145 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3395  thioesterase superfamily protein  44.96 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114226  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  43.28 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  43.31 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3593  thioesterase superfamily protein  44.96 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.741645  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  45.74 
 
 
145 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0906  hypothetical protein  44.96 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398679  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3470  thioesterase superfamily protein  44.96 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.743787  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  44.19 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1188  phenylacetic acid degradation-related protein  47.54 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.771738  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0892  thioesterase superfamily protein  44.19 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.915602  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  44.19 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  45.86 
 
 
140 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3008  hypothetical protein  44.19 
 
 
145 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0246999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  45.24 
 
 
138 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2201  thioesterase superfamily protein  49.12 
 
 
130 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  47.01 
 
 
136 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  43.08 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  44 
 
 
141 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  47.01 
 
 
136 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  47.01 
 
 
136 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  47.01 
 
 
136 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  47.01 
 
 
136 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  47.01 
 
 
136 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  47.01 
 
 
136 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  47.01 
 
 
136 aa  106  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  48.74 
 
 
145 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1474  thioesterase superfamily protein  48.67 
 
 
137 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55037  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  46.15 
 
 
136 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
136 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12960  hypothetical protein  47.11 
 
 
154 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.552344  normal  0.38168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  46.15 
 
 
136 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  44 
 
 
144 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  46.15 
 
 
136 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  47.01 
 
 
136 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  46.15 
 
 
136 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  42.5 
 
 
146 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>