266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0530 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  100 
 
 		 124 aa  258  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0944  hypothetical protein  72.58 
 
 		 124 aa  196  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00659595  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0963  hypothetical protein  72.58 
 
 		 124 aa  196  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000957659  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  50.83 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  47.46 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  47.46 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  47.46 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  47.46 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  49.58 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  47.46 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  47.46 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  47.46 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  46.61 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 		 134 aa  123  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  46.61 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  46.61 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  45.76 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  43.44 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  47.01 
 
 		 165 aa  113  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  42.5 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  47.75 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  44.07 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  40.52 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  42.11 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  42.11 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  46.94 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  46.9 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  44.54 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  44.76 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  39.83 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  40.68 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  46.53 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  45.13 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  41.53 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  47.71 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  44.25 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  44.25 
 
 		 157 aa  97.8  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  40.17 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  38.79 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  44.25 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  39.83 
 
 		 136 aa  95.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  44.55 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  41.53 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  41.53 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  41.53 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  41.53 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  41.53 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  47.42 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  46.39 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3008  hypothetical protein  39.32 
 
 		 145 aa  94.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0246999  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  46.39 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  37.39 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  44.33 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1757  hypothetical protein  45.92 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  39.83 
 
 		 136 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  39.83 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  39.83 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  39.83 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  39.83 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  39.83 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  39.83 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  37.61 
 
 		 147 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  39.5 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  40.68 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  39.83 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  35.9 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  38.14 
 
 		 195 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1068  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3031  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.499419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0943  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.321033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  43.24 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0906  hypothetical protein  37.61 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  39.83 
 
 		 136 aa  90.9  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  44 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  38.74 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3395  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  43.27 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3470  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.743787  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  43.27 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3593  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.741645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  43.27 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  42.27 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3942  hypothetical protein  35.9 
 
 		 145 aa  88.6  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  40.38 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  45.36 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0892  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.915602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  41.23 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  43.43 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2002  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  36.75 
 
 		 142 aa  87  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  34.19 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  38.79 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3092  phenylacetic acid degradation-related protein  34.19 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2944  hypothetical protein  35.04 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>