207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12960 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12960  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  303  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.552344  normal  0.38168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3846  thioesterase superfamily protein  59.33 
 
 
151 aa  176  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3007  hypothetical protein  58.7 
 
 
155 aa  171  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1188  phenylacetic acid degradation-related protein  61.94 
 
 
141 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.771738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2965  hypothetical protein  71.3 
 
 
142 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0165081  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2853  thioesterase superfamily protein  63.91 
 
 
152 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000521019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1474  thioesterase superfamily protein  62.02 
 
 
137 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55037  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5533  thioesterase superfamily protein  63.48 
 
 
136 aa  159  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2201  thioesterase superfamily protein  64.41 
 
 
130 aa  159  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1508  thioesterase superfamily protein  60.33 
 
 
132 aa  155  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2042  thioesterase superfamily protein  64.46 
 
 
164 aa  154  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.379311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5678  thioesterase superfamily protein  58.27 
 
 
143 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0958  thioesterase superfamily protein  64.96 
 
 
142 aa  153  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1970  thioesterase superfamily protein  58.68 
 
 
133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19363  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20230  hypothetical protein  60.5 
 
 
137 aa  150  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25970  hypothetical protein  61.95 
 
 
147 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1801  thioesterase superfamily protein  50.69 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2062  hypothetical protein  56.9 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00354205  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3202  thioesterase superfamily protein  56.78 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11110  hypothetical protein  56.78 
 
 
172 aa  136  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3038  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 
154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000070991  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1225  thioesterase superfamily protein  55.37 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.541644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3256  hypothetical protein  46.46 
 
 
140 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3054  thioesterase superfamily protein  47.45 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  46.51 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 
144 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 
139 aa  114  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 
136 aa  114  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  48.06 
 
 
134 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  49.17 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  43.18 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  43.38 
 
 
138 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  43.38 
 
 
138 aa  111  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  43.38 
 
 
138 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  46.62 
 
 
144 aa  110  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  44.78 
 
 
140 aa  110  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 
142 aa  110  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  50.86 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  50 
 
 
140 aa  110  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  50.43 
 
 
195 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  47.69 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1024  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  53.21 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  46.02 
 
 
137 aa  107  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  49.57 
 
 
142 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  48.25 
 
 
124 aa  107  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  49.18 
 
 
150 aa  107  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 
142 aa  107  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0652  hypothetical protein  47.37 
 
 
137 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0695  hypothetical protein  47.37 
 
 
137 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0329769 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0757  hypothetical protein  47.37 
 
 
137 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0711  hypothetical protein  47.37 
 
 
137 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276365  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 
138 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 
138 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0638  hypothetical protein  46.49 
 
 
137 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  47.11 
 
 
135 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  45.61 
 
 
138 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  46.67 
 
 
139 aa  105  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00564  hypothetical protein  45.38 
 
 
137 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3029  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 
137 aa  104  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.99639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00553  hypothetical protein  45.38 
 
 
137 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0499  hypothetical protein  45.38 
 
 
137 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  45.38 
 
 
137 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  47.93 
 
 
148 aa  104  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  42.86 
 
 
150 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  49.15 
 
 
140 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  42.5 
 
 
127 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3047  hypothetical protein  45.38 
 
 
137 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  45.38 
 
 
137 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0617  hypothetical protein  45.38 
 
 
137 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0682  hypothetical protein  45.38 
 
 
137 aa  104  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  46.67 
 
 
172 aa  104  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  48.74 
 
 
144 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  47.79 
 
 
140 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  45.83 
 
 
146 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  42.98 
 
 
136 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  49.12 
 
 
147 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  42.98 
 
 
136 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 
136 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  43.48 
 
 
147 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  45.93 
 
 
142 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0199  phenylacetic acid degradation-related protein  40.14 
 
 
155 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 
145 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  42.98 
 
 
136 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  42.98 
 
 
136 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  42.15 
 
 
136 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  42.98 
 
 
136 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  42.98 
 
 
136 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  50.91 
 
 
147 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 
138 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  42.75 
 
 
147 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  42.74 
 
 
127 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  49.17 
 
 
140 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  47.5 
 
 
151 aa  100  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  43.33 
 
 
140 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 
127 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 
136 aa  100  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  41.88 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>