197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1225 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1225  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
152 aa  307  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.541644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1970  thioesterase superfamily protein  62.6 
 
 
133 aa  149  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19363  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2201  thioesterase superfamily protein  62.81 
 
 
130 aa  147  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5533  thioesterase superfamily protein  52.52 
 
 
136 aa  138  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1508  thioesterase superfamily protein  55.38 
 
 
132 aa  135  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3846  thioesterase superfamily protein  53.9 
 
 
151 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2965  hypothetical protein  56.59 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0165081  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3007  hypothetical protein  52.94 
 
 
155 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2853  thioesterase superfamily protein  52.74 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000521019  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12960  hypothetical protein  55.37 
 
 
154 aa  130  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.552344  normal  0.38168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2042  thioesterase superfamily protein  48 
 
 
164 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.379311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20230  hypothetical protein  52.27 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1474  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 
137 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55037  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1188  phenylacetic acid degradation-related protein  52.59 
 
 
141 aa  120  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.771738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0958  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 
142 aa  120  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5678  thioesterase superfamily protein  52.17 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25970  hypothetical protein  44.88 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3038  thioesterase superfamily protein  46.62 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000070991  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3202  thioesterase superfamily protein  46.9 
 
 
134 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2062  hypothetical protein  48.31 
 
 
132 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00354205  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  49.18 
 
 
142 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11110  hypothetical protein  48.25 
 
 
172 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1801  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 
155 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  41.86 
 
 
138 aa  95.5  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 
138 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  41.86 
 
 
138 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  42.4 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  44.53 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  46.09 
 
 
195 aa  90.1  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  39.23 
 
 
146 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  39.83 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 
140 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  39.23 
 
 
157 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 
138 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  40.44 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  47.62 
 
 
140 aa  87  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 
138 aa  86.7  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  40.85 
 
 
149 aa  86.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1486  thioesterase superfamily protein  43.33 
 
 
139 aa  87  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63041  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  43.36 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0710753 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00564  hypothetical protein  42.64 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3029  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.99639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3047  hypothetical protein  42.64 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  42.64 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  44.35 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0499  hypothetical protein  42.64 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  42.52 
 
 
140 aa  86.3  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  45.3 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1757  hypothetical protein  43.59 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3256  hypothetical protein  36.3 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00553  hypothetical protein  42.64 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  42.64 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0617  hypothetical protein  42.64 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0695  hypothetical protein  43.18 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0329769 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0757  hypothetical protein  43.18 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0711  hypothetical protein  43.18 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276365  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0682  hypothetical protein  42.64 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0652  hypothetical protein  43.18 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3054  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14970  hypothetical protein  42.74 
 
 
178 aa  84.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0638  hypothetical protein  42.42 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  38.93 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  39.53 
 
 
140 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  39.53 
 
 
140 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 
141 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  41.22 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  43.36 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  43.22 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0199  phenylacetic acid degradation-related protein  41.35 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  43.7 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  38.84 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  38.98 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  36.64 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  36.64 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  36.64 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  36.64 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  38.98 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  36.64 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  36.64 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  42.11 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  42.11 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  38.14 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  38.14 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  38.14 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  38.14 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  35.88 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  38.18 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  38.84 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  44.68 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>