204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5533 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5533  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3846  thioesterase superfamily protein  64 
 
 		 151 aa  170  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12960  hypothetical protein  63.48 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.552344  normal  0.38168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1970  thioesterase superfamily protein  63.25 
 
 		 133 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1508  thioesterase superfamily protein  58.91 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25970  hypothetical protein  55.73 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2201  thioesterase superfamily protein  65.22 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5678  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 		 143 aa  150  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1474  thioesterase superfamily protein  54.81 
 
 		 137 aa  150  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2965  hypothetical protein  53.57 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0165081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3007  hypothetical protein  51.41 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2853  thioesterase superfamily protein  60.68 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000521019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20230  hypothetical protein  56.69 
 
 		 137 aa  145  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1188  phenylacetic acid degradation-related protein  57.26 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.771738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0958  thioesterase superfamily protein  59.48 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1225  thioesterase superfamily protein  52.52 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.541644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3038  thioesterase superfamily protein  53.78 
 
 		 154 aa  136  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000070991  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1801  thioesterase superfamily protein  50.76 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2042  thioesterase superfamily protein  50.37 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.379311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3202  thioesterase superfamily protein  58.04 
 
 		 134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11110  hypothetical protein  50.38 
 
 		 172 aa  129  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2062  hypothetical protein  51.69 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00354205  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3054  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3256  hypothetical protein  46.15 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453246  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00564  hypothetical protein  48.74 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3029  thioesterase superfamily protein  48.74 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.99639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00553  hypothetical protein  48.74 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  48.74 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3047  hypothetical protein  48.74 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0499  hypothetical protein  48.74 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  48.74 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0617  hypothetical protein  48.74 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0682  hypothetical protein  48.74 
 
 		 137 aa  110  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  47.79 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0652  hypothetical protein  46.22 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0711  hypothetical protein  46.22 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0757  hypothetical protein  46.22 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0695  hypothetical protein  46.22 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0329769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0638  hypothetical protein  46.22 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  41.6 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  48.06 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  42.86 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  44.8 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  44.8 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  44.8 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  43.18 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2401  hypothetical protein  43.2 
 
 		 136 aa  100  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  41.22 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  42.86 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01655  hypothetical protein  42.4 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1956  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.71253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 		 127 aa  98.2  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1510  hypothetical protein  42.4 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.564013  hitchhiker  0.000000864197 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01644  hypothetical protein  42.4 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.243206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  41.67 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1767  hypothetical protein  42.4 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1902  hypothetical protein  42.4 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0509898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1887  hypothetical protein  41.6 
 
 		 136 aa  97.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  39.5 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 		 138 aa  96.7  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  39.5 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  39.5 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  41.6 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  39.5 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  39.5 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  39.5 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  39.5 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  39.5 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  42.86 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  44.25 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  44.25 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  40.77 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  38.66 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1945  hypothetical protein  41.6 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  43.44 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1977  hypothetical protein  41.6 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  44.04 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1806  hypothetical protein  41.6 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0972306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1497  hypothetical protein  41.6 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  45.87 
 
 		 150 aa  94.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1478  hypothetical protein  41.6 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301889  hitchhiker  0.0000119819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 144 aa  93.6  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  42.64 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  41.18 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  40.6 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1462  hypothetical protein  40.8 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  41.6 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  40.3 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14970  hypothetical protein  45.38 
 
 		 178 aa  91.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  40.3 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  43.24 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1757  hypothetical protein  42.98 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  43.24 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>