195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3007 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3007  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  313  6e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1188  phenylacetic acid degradation-related protein  65.12 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.771738  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12960  hypothetical protein  58.7 
 
 		 154 aa  171  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.552344  normal  0.38168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1970  thioesterase superfamily protein  66.1 
 
 		 133 aa  167  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2853  thioesterase superfamily protein  65.35 
 
 		 152 aa  166  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000521019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3846  thioesterase superfamily protein  68.38 
 
 		 151 aa  164  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2965  hypothetical protein  68.7 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0165081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1474  thioesterase superfamily protein  62.02 
 
 		 137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2042  thioesterase superfamily protein  61.72 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.379311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20230  hypothetical protein  60.31 
 
 		 137 aa  157  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0958  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 		 142 aa  157  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1801  thioesterase superfamily protein  62.9 
 
 		 155 aa  153  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000552689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1508  thioesterase superfamily protein  61.29 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5678  thioesterase superfamily protein  54.23 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2062  hypothetical protein  61.11 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00354205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5533  thioesterase superfamily protein  51.41 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11110  hypothetical protein  60.34 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2201  thioesterase superfamily protein  57.02 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25970  hypothetical protein  52.54 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3038  thioesterase superfamily protein  49.29 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000070991  hitchhiker  0.00472926 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1225  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.541644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3256  hypothetical protein  52.03 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3054  thioesterase superfamily protein  49.32 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3202  thioesterase superfamily protein  47.9 
 
 		 134 aa  126  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  53.66 
 
 		 139 aa  123  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  49.58 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  52.5 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  51.28 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  47.33 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  50.4 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  45.97 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  45.97 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  45.97 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  47.11 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  45.69 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0711  hypothetical protein  46.9 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0695  hypothetical protein  46.9 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0329769 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  47.71 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0652  hypothetical protein  46.9 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00564  hypothetical protein  43.61 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3029  thioesterase superfamily protein  43.61 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.99639  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0638  hypothetical protein  46.02 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0499  hypothetical protein  43.61 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00553  hypothetical protein  43.61 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  43.61 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0617  hypothetical protein  43.61 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3047  hypothetical protein  43.61 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  43.61 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0682  hypothetical protein  43.61 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  47.5 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  46.83 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0757  hypothetical protein  46.02 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  48.25 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0064  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 		 140 aa  104  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0523  hypothetical protein  46.55 
 
 		 195 aa  103  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  42.5 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0199  phenylacetic acid degradation-related protein  43.36 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  47.5 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  47.41 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  42.14 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  44.63 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  42.14 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 		 135 aa  102  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  49.57 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  45.13 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  40.65 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  44.09 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  45 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  45.69 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  45.53 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2216  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  40.3 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  48.72 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  41.32 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  43.59 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  47.15 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  43.33 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  44.17 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  44.17 
 
 		 127 aa  97.1  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2025  phenylacetic acid degradation-related protein  39.85 
 
 		 147 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  43.33 
 
 		 157 aa  96.7  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  43.07 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  43.33 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  43.33 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  43.28 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1748  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1486  thioesterase superfamily protein  47.71 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  43.33 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  43.33 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  43.33 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  43.33 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14970  hypothetical protein  44.09 
 
 		 178 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  44.04 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  43.33 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  41.8 
 
 		 139 aa  95.5  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  40.65 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>