More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1320 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 131 aa  269  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  56.2 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  57.02 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  57.02 
 
 		 160 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  54.55 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  52.07 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  49.59 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  51.22 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  40.16 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  41.23 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  35.54 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  35.43 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  35.38 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  34.65 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  34.38 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  34.65 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  33.88 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  34.48 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  35.14 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  31.97 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2311  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1474  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3484  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11875  hypothetical protein  28.95 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0963448  normal  0.270095 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  34.65 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  33.63 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.91 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  38.2 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 232 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0930  phenylacetic acid degradation-related protein  32.26 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.84 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  35.37 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2002  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  33.06 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  31.03 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1486  thioesterase superfamily protein  35.23 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63041  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  37.23 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  37.89 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  31.73 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  31.73 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  35 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  32.76 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  33.93 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2759  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0533783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  31.03 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  30.08 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  31.36 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  30.08 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  28.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  28.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  30.51 
 
 		 251 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.31 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  26.89 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  27.83 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>