More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05030 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  100 
 
 
127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  75 
 
 
128 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  55.93 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  54.24 
 
 
129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  54.24 
 
 
129 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  50.85 
 
 
127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  50.85 
 
 
127 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  50.85 
 
 
127 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  50.85 
 
 
127 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  49.15 
 
 
127 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  48.31 
 
 
127 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  37.69 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  36.59 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.37 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  36.04 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  32.46 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  40.16 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  40.16 
 
 
177 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  40.16 
 
 
177 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  40.16 
 
 
177 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  40.16 
 
 
238 aa  67  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  35.29 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  40.16 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  40.16 
 
 
374 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  35.29 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  34.17 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1780  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 
179 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  36.27 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  36.89 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  36.89 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  36.89 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  32.76 
 
 
161 aa  60.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  36.89 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  34.78 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  33.61 
 
 
160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
161 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  33.61 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  33.61 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  28.95 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  33.61 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  33.61 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  33.61 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  33.61 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  33.61 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.29 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.88 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  35.83 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.94 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2890  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  28.07 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.51 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  30.84 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1079  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
166 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.38 
 
 
146 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
191 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.14 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  38.18 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.04 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.19 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.14 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  34.51 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>