221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3091 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  322  9e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  51.94 
 
 
147 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  51.16 
 
 
147 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  48.06 
 
 
147 aa  130  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  47.01 
 
 
154 aa  124  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  46.21 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  43.18 
 
 
154 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0328  thioesterase superfamily protein  55.04 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  29.66 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  29.66 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  29.66 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  29.66 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  29.66 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  29.66 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  29.66 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  29.66 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  29.66 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  29.66 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  38.04 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  28.81 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  29.66 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
154 aa  57.4  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  27.78 
 
 
153 aa  57.4  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
139 aa  57.4  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  29.52 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  34.62 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  31.09 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
134 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  33.01 
 
 
183 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  23.97 
 
 
135 aa  54.3  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 
146 aa  54.3  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  28.33 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  28.33 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  35.87 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  32.08 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.87 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  30.3 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  37.14 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31 
 
 
147 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  27.35 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  26.03 
 
 
161 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
142 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.17 
 
 
148 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
159 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  27.5 
 
 
159 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
134 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  27.35 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  27.35 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  27.35 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  27.35 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  27.35 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  24.58 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3047  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.62 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1448  hypothetical protein  38.18 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.043674  normal  0.0181319 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  27.35 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  27.35 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
144 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  26.9 
 
 
165 aa  51.2  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  33.02 
 
 
139 aa  51.2  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  24.58 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
144 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  24.66 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.56 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.56 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  35.05 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  35.87 
 
 
127 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.31 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  28.45 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  28.45 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  38.37 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  28.68 
 
 
143 aa  48.5  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  29.27 
 
 
140 aa  47.8  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
138 aa  47.4  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
138 aa  47.4  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  23.53 
 
 
144 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 
155 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  26.72 
 
 
154 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>