237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2244 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
153 aa  315  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  66 
 
 
150 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  61.38 
 
 
147 aa  197  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  60.69 
 
 
147 aa  189  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  57.24 
 
 
147 aa  184  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  62.4 
 
 
146 aa  159  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  58.46 
 
 
154 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  44.06 
 
 
154 aa  120  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  44.44 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0328  thioesterase superfamily protein  43.57 
 
 
155 aa  87.8  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  34.15 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  38.64 
 
 
209 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  40 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  32.48 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
137 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  31.62 
 
 
159 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  31.62 
 
 
159 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
159 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  33.07 
 
 
161 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  35.63 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
161 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  36.78 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  32.41 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.43 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  36.78 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  36.78 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  36.78 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
183 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  36.78 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  36.78 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  30.69 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  36.78 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  36.78 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  31.78 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
233 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  27.97 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  31.2 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  31.2 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  31.2 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.05 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  28.24 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
135 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  29.31 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  30.17 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  30.17 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  36.05 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.39 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  32.99 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  30.17 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.71 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  31.03 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  30.88 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  37.38 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2156  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  31.25 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  34.78 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  36.36 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  29.31 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  47.83 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  30.17 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  30.17 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  30.17 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  30.17 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  30.17 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  35.23 
 
 
191 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  30.17 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.06 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  30.17 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.62 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
213 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  26.56 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.48 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  30.86 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.78 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  41.38 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 
181 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  29.13 
 
 
154 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
155 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  32.22 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>