231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0328 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0328  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  55.04 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  48.06 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  43.57 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  45.77 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  46.03 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  46.4 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  43.57 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  43.88 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  46.4 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  35.64 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  33.9 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  39.08 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  31.93 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.62 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  31.07 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  35.29 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  33.68 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  35.24 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  31.07 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  31.07 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  31.07 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  31.07 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  31.07 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  31.07 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  31.07 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  36.78 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  31.07 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  31.07 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  35 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  26.92 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  31.9 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  26.92 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  26.92 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  31.07 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  26.92 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  26.92 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  28.46 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  26.92 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  36.56 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  36.56 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  26.92 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  26.92 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  36.36 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  30.1 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  32.08 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  38.75 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  35.06 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.47 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  35.06 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  30.1 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  35.06 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  35.48 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.97 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  35 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  35.48 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  35.48 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.8 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.27 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  36 
 
 		 251 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.75 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  29.46 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2002  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  33.77 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  33.77 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  35.48 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.13 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.31 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  34.09 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1465  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.856365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.05 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  28.8 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  29.08 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>