260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1553 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 140 aa  286  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  72.06 
 
 		 144 aa  201  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  72.39 
 
 		 163 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  71.64 
 
 		 163 aa  197  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  71.09 
 
 		 151 aa  186  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  62.04 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 		 167 aa  130  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 		 233 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  40.3 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  39.55 
 
 		 175 aa  116  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  39.55 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  39.55 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  39.55 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  45.16 
 
 		 304 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  42.45 
 
 		 295 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  44.12 
 
 		 319 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  38.24 
 
 		 329 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  40.16 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  38.06 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  37.31 
 
 		 334 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  35.82 
 
 		 169 aa  105  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  35.82 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  42.11 
 
 		 301 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  38.24 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  41.98 
 
 		 162 aa  104  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  38.97 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 332 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  36.76 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  38.24 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  39.53 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  39.53 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  39.83 
 
 		 167 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  39.53 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  37.21 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  36.23 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  43.96 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  35.77 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  34.29 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  30.71 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  33.57 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  29.13 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  36.59 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  33.07 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  30.23 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  31.78 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  30.53 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  27.4 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  37.35 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  28.28 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  28.15 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  27.74 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  29.23 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  27.01 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  27.01 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  32.09 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  27.01 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  27.01 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  27.01 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  27.01 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  27.01 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  27.41 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  30.12 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  27.01 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  26.28 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  26.28 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  26.28 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  26.28 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  26.28 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  39.76 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  31.15 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  30.56 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  28.03 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>