165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3752 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 158 aa  329  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  96.84 
 
 		 158 aa  321  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  95.57 
 
 		 158 aa  317  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  90.51 
 
 		 158 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  63.92 
 
 		 159 aa  222  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  64.29 
 
 		 178 aa  216  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  67.12 
 
 		 157 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  66.44 
 
 		 157 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  47.89 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  44.81 
 
 		 329 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  45.83 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  45.14 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  45.14 
 
 		 332 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  45.14 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  43.75 
 
 		 175 aa  137  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  43.06 
 
 		 335 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  43.75 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  43.75 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  43.75 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  43.75 
 
 		 334 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  37.96 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 		 233 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  43.8 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  44.06 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  43.55 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  40.15 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  39.39 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  48.48 
 
 		 319 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  38.28 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  47.47 
 
 		 295 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  46.46 
 
 		 301 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  46.46 
 
 		 304 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  39.53 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  37.98 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  31.5 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  36.08 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  33.81 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  32.08 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  30.4 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  32.99 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  30.71 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  30.48 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  25.69 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  25.33 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  27.88 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  27.1 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  26.43 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  25 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  26.28 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  24.53 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  24.53 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  24.53 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  25.96 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  33.72 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  35.06 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  24.83 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  26.4 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  23.81 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  32.1 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  31.17 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  26.32 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  24.04 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  27.47 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  24.32 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  29.21 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  31.37 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  24.04 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  24.04 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  24.04 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  24.66 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  23.08 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  25.4 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>