272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1115 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
138 aa  279  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  54.35 
 
 
138 aa  166  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  56.59 
 
 
150 aa  155  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  46.77 
 
 
139 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  44.03 
 
 
151 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  38.4 
 
 
151 aa  84.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  40.98 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  33.86 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  36.51 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  38.52 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  28.77 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  35.66 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  29.45 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  35.94 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  32.54 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  34.09 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  34.25 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  34.38 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  28.77 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  27.97 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  28.08 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  28.08 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  28.08 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  28.67 
 
 
154 aa  67  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
233 aa  67  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  28.47 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  39.26 
 
 
157 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  28.08 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  33.83 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  28.08 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  32.09 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  27.4 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  27.4 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  27.4 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  32.81 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  34.78 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  35.25 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  35.25 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
167 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  31.34 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  26.71 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  29.58 
 
 
162 aa  60.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  35.48 
 
 
163 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  34.15 
 
 
162 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  31.67 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  30.3 
 
 
155 aa  60.1  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  36 
 
 
162 aa  60.1  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  33.88 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  27.82 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  27.82 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  27.82 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  28.08 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  28.08 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  28.15 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  28.08 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  28.08 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  28.57 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  28.08 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  32.52 
 
 
295 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
304 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  31.15 
 
 
319 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  30.4 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  33.91 
 
 
329 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  32.99 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  27.78 
 
 
159 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  37.18 
 
 
158 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  28.08 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>