128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4894 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
139 aa  281  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  51.08 
 
 
141 aa  152  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  48.57 
 
 
145 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  45.95 
 
 
167 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
173 aa  140  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  50.81 
 
 
147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  44.08 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  44.22 
 
 
168 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  44.22 
 
 
168 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
165 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
165 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
165 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
154 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
154 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  50.81 
 
 
155 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
154 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  50.81 
 
 
329 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  49.19 
 
 
154 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
165 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
332 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  48.39 
 
 
159 aa  134  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  49.19 
 
 
334 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  47.58 
 
 
335 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  46.77 
 
 
144 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  40.4 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  40.54 
 
 
172 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 
150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  45.9 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  46.28 
 
 
304 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 
150 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  46.46 
 
 
152 aa  114  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  45.08 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  46.09 
 
 
301 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  45.08 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  41.09 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 
160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  42.62 
 
 
319 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  42.62 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  41.8 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  40.8 
 
 
163 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  41.6 
 
 
163 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  41.94 
 
 
137 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  33.81 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  32.87 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  34.43 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  31.01 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  32.12 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  28.93 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  28.46 
 
 
178 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
233 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  29.6 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  30.88 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  27.59 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  29.84 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  26.17 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  30 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  27.59 
 
 
180 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
144 aa  53.5  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  26.36 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  31.62 
 
 
151 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  26.98 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  30.08 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  27.78 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  25 
 
 
152 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  27.91 
 
 
163 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  27.91 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  27.56 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  31.2 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  25.52 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  28.44 
 
 
175 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  25.98 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  25.98 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  25.98 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
175 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  28.44 
 
 
175 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  28.44 
 
 
175 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
175 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
175 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
175 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  28.44 
 
 
175 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
158 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  27.05 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  27.87 
 
 
154 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  25.6 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  27.05 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  27.05 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  27.05 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  27.64 
 
 
161 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  27.64 
 
 
161 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>