149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0880 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
150 aa  303  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  52 
 
 
159 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  52.07 
 
 
334 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  51.2 
 
 
332 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  52 
 
 
165 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  52 
 
 
165 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  52 
 
 
165 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  52 
 
 
154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  52 
 
 
154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  52 
 
 
154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  52 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 
147 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  50.4 
 
 
168 aa  134  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 
155 aa  133  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  51.24 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  52.8 
 
 
329 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  51.2 
 
 
335 aa  131  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  53.78 
 
 
160 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  53.78 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 
160 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 
160 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  52.94 
 
 
148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 
148 aa  124  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  51.26 
 
 
148 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  47.2 
 
 
144 aa  120  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  51.22 
 
 
150 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  53.66 
 
 
152 aa  120  8e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 
139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  42.36 
 
 
145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  43.24 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  42.86 
 
 
168 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
168 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 
167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  43.51 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 
144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  36.73 
 
 
172 aa  100  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  40.32 
 
 
319 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 
304 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  38.84 
 
 
295 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  40.16 
 
 
301 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  37.6 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  37.6 
 
 
163 aa  87.8  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  39.26 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  28.15 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
233 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  32.35 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  30.88 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
155 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  29.63 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  27.48 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
175 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  29.66 
 
 
178 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  25.9 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
175 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
175 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
175 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  27.69 
 
 
163 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  26.95 
 
 
167 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  27.05 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  27.08 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  27.27 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  27.05 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  27.05 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  30.88 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  27.05 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  28.24 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  27.05 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  30 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  26.92 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  29.61 
 
 
156 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  27.46 
 
 
137 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  27.82 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  32.58 
 
 
157 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  29.71 
 
 
157 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  25.41 
 
 
180 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  29.2 
 
 
161 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  29.2 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  29.2 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  29.2 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  24.81 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  29.2 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  29.2 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  29.2 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  29.2 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  27.46 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>