111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4180 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  97.48 
 
 		 160 aa  322  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  94.38 
 
 		 160 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  74.15 
 
 		 150 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  70.55 
 
 		 148 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  67.81 
 
 		 148 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  68.09 
 
 		 148 aa  205  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  55.32 
 
 		 332 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  58.39 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  56.03 
 
 		 334 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  56.74 
 
 		 147 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 154 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  57.46 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  53.9 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  57.46 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  57.46 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  57.46 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  54.86 
 
 		 165 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  54.86 
 
 		 165 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  54.86 
 
 		 165 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  54.86 
 
 		 335 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  54.86 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  54.61 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  53.47 
 
 		 329 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 		 150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  44.03 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  45.07 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  45.08 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  42.28 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  38.61 
 
 		 173 aa  110  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  38.85 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  38.22 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  38.22 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  36.2 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  39.85 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  40.16 
 
 		 295 aa  97.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  39.84 
 
 		 301 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  38.71 
 
 		 319 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  39.52 
 
 		 304 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  37.5 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  27.61 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  27.64 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  24.06 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  28.68 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  23.57 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  23.57 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  29.59 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  28.44 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 233 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  31.25 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 154 aa  47.4  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  27.78 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  30.36 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  28.77 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  28.4 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  30.36 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  29.46 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  30.36 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  30.36 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  30.36 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  28.68 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  28.36 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  29.85 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 159 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  28.36 
 
 		 161 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  28.36 
 
 		 161 aa  43.9  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  28.36 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  25 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  21.92 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  28.36 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  30.28 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  27.61 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  28.36 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  28.36 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  28.36 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  30.11 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  30.28 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  29.85 
 
 		 162 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  24.63 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  28.36 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  28.36 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  28.36 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>