139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2494 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 159 aa  330  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  79.87 
 
 		 157 aa  266  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  78.62 
 
 		 157 aa  265  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  73.38 
 
 		 178 aa  244  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  63.92 
 
 		 158 aa  223  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  63.92 
 
 		 158 aa  222  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  63.29 
 
 		 158 aa  221  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  62.03 
 
 		 158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  54.17 
 
 		 180 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  54.29 
 
 		 329 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  55.94 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  52.08 
 
 		 169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  51.39 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  51.8 
 
 		 335 aa  157  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  50.69 
 
 		 175 aa  157  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  52.08 
 
 		 175 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  52.08 
 
 		 175 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  52.08 
 
 		 175 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  52.08 
 
 		 175 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  50.69 
 
 		 175 aa  156  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  50.69 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  50.69 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  54.81 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 		 332 aa  154  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  51.11 
 
 		 334 aa  153  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 		 233 aa  131  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  45.99 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  42.11 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  49.11 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  40.88 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  41.01 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  40.15 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  42.34 
 
 		 140 aa  107  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  36.69 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  37.59 
 
 		 319 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  45.45 
 
 		 301 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  35.86 
 
 		 304 aa  94.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  44.44 
 
 		 295 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  34.09 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  35.16 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  33.01 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  27.4 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  27.86 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  31.76 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  31.87 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  24.64 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  27.2 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  28 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  28.47 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  28.47 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  28.47 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  34.25 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 126 aa  47.4  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 149 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  26.19 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  31.91 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  27.74 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  35.06 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  26.67 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  24 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  31.4 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  26.67 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  25.74 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  23.53 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  31.08 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  29.27 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  30.3 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  33.8 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  32.67 
 
 		 147 aa  44.3  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  26.83 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  24.83 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  31.87 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  32.47 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  23.97 
 
 		 154 aa  43.9  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  25.74 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  25.74 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  33.77 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  27.03 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  25.74 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  25.74 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  22.67 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>