162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1523 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  351  2.9999999999999997e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  90.85 
 
 		 180 aa  317  7e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  83.44 
 
 		 175 aa  295  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  83.44 
 
 		 175 aa  295  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  83.44 
 
 		 175 aa  295  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  85.19 
 
 		 165 aa  293  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  82.82 
 
 		 175 aa  293  9e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  81.6 
 
 		 175 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  81.6 
 
 		 175 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  81.6 
 
 		 175 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  81.6 
 
 		 175 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  81.48 
 
 		 335 aa  287  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  80.25 
 
 		 332 aa  287  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  80.37 
 
 		 334 aa  286  8e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  82.61 
 
 		 329 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  74.85 
 
 		 168 aa  254  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  57.14 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  56.43 
 
 		 157 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  52.08 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  52.7 
 
 		 156 aa  161  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  48.1 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  45.14 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  45.14 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  45.14 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  45.14 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  37.85 
 
 		 233 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  48.78 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  48.03 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  37.88 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  42.96 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  39.1 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  37.12 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  35.82 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  40.31 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  41.67 
 
 		 319 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  44.07 
 
 		 301 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  40.91 
 
 		 295 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 304 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  37.1 
 
 		 167 aa  98.2  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 		 158 aa  97.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  34.93 
 
 		 162 aa  94  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  33.82 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  29.46 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  33.09 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  28.68 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  35.04 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  29.37 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  33.9 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  33.03 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  30.4 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  30.07 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  32.17 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  26.97 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  31.06 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  29.08 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  32.29 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 128 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  30.51 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  28.38 
 
 		 144 aa  50.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  30.25 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  27.97 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  26.03 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  31.48 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  26.03 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  26.03 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  26.03 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  26.03 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  25.52 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  25.52 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  25.52 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  25.52 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  25.52 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  25.52 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  25.52 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  25.52 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  32.43 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  25.52 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  29.25 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  26.09 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.47 
 
 		 126 aa  48.5  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  31.19 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  25.87 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  32.47 
 
 		 199 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>