183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4343 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  319  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  319  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  319  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  319  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  319  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  96.77 
 
 		 155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  96.77 
 
 		 155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  96.77 
 
 		 155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  96.77 
 
 		 155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  96.77 
 
 		 155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  96.77 
 
 		 155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  96.77 
 
 		 161 aa  310  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  96.77 
 
 		 161 aa  310  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  96.13 
 
 		 161 aa  309  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  92.9 
 
 		 155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  66.89 
 
 		 156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  66.89 
 
 		 156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  66.89 
 
 		 156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  68.87 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  65.56 
 
 		 162 aa  205  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  65.56 
 
 		 162 aa  205  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  62.58 
 
 		 156 aa  199  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  62.5 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  50.32 
 
 		 154 aa  157  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  49.03 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  49.66 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  49.03 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  48.39 
 
 		 154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  48.39 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  48.39 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  48.39 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  49.32 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  48.98 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  47.26 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  46.36 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  46.94 
 
 		 154 aa  150  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  46.26 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  47.1 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  44.9 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  48.55 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  47.83 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  43.71 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  37.14 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  35.97 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  33.81 
 
 		 163 aa  97.1  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  36.91 
 
 		 169 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  35.97 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  34.75 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  33.57 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  34.29 
 
 		 188 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  28.78 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  26.53 
 
 		 233 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 304 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  28.08 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  31.62 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  26.28 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 		 295 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  27.21 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  26.72 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.01 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  29.45 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  25.9 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  29.86 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  25.18 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  26.97 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  31.15 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  25.36 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  30.58 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  29.71 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  27.54 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  27.34 
 
 		 301 aa  51.2  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  28.99 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  27.86 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  26.03 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  28.89 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  28.89 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  25.52 
 
 		 329 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  34.41 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  24.24 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  30.56 
 
 		 335 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>