232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2647 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 138 aa  286  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  54.35 
 
 		 138 aa  166  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  51.13 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  46.97 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  43.18 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  36.11 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  36.99 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  34.85 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  33.79 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  32.8 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2124  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  31.54 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  35.11 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  29.14 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  30.53 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  31.25 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  33.83 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  31.67 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  33.85 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  30.6 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  29.93 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  31.07 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  29.71 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  36.07 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  27.81 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  33.59 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  26.95 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  32.79 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  28.47 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  32.79 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  27.74 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  26.21 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  28.37 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  25.53 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  31.11 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  25.9 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  26.09 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  26.09 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  34.15 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  34.69 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  34.15 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  26.09 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  26.09 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  25.53 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  25.53 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  30.47 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1582  phenylacetic acid degradation-like protein  33.9 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000511967  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  25.53 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  25.53 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  27.27 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  27.27 
 
 		 335 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  27.61 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  27.56 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  31.58 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  31.58 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  31.58 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  30.58 
 
 		 329 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  26.32 
 
 		 156 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  26.32 
 
 		 156 aa  52  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  28.15 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  26.32 
 
 		 156 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  26.42 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  30.58 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>