153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1344 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  330  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  72.96 
 
 		 160 aa  241  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  72.33 
 
 		 160 aa  240  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  72.05 
 
 		 163 aa  239  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  76.82 
 
 		 169 aa  236  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  71.61 
 
 		 162 aa  234  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  70.06 
 
 		 188 aa  228  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  56.94 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  44.44 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  43.42 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  43.45 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  40.26 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  45.32 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  43.95 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  42.68 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  41.73 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  43.57 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  41.83 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  41.83 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  41.83 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  41.83 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  40.13 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  40.52 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  40.91 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  40.91 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  40.91 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  39.57 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  43.66 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  38.31 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  39.57 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  41.43 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  39.72 
 
 		 156 aa  97.8  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  37.14 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  35.97 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  35.97 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  35.97 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  35.97 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  35.97 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  35.25 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  35.25 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  35.25 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  35.25 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  35.97 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  35.25 
 
 		 161 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  35.25 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  35.25 
 
 		 161 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  35.25 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  36.69 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  36.69 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  36.69 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  35.46 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  31.54 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  37.61 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  28.78 
 
 		 151 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  30.53 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  32.09 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  32.09 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  31.34 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  31.34 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  31.34 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  33.9 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  33.09 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  30.33 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  28.68 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  32.2 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  32.09 
 
 		 329 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  31.88 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  32.12 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  26.62 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  30.6 
 
 		 334 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  32.33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 		 332 aa  53.9  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  33.87 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  33.87 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  26.06 
 
 		 304 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  26.67 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  26.92 
 
 		 319 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  22.66 
 
 		 135 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 233 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  35.23 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  30.43 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>