99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1524 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 155 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  95.1 
 
 		 147 aa  289  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  80.52 
 
 		 154 aa  271  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  80.52 
 
 		 154 aa  271  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  80.52 
 
 		 154 aa  271  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  81.58 
 
 		 159 aa  270  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  82.99 
 
 		 332 aa  267  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  78.71 
 
 		 165 aa  266  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  81.82 
 
 		 165 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  81.82 
 
 		 165 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  81.82 
 
 		 165 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  79.73 
 
 		 168 aa  262  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  81.12 
 
 		 335 aa  261  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  81.82 
 
 		 334 aa  259  8e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  78.38 
 
 		 154 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  75 
 
 		 329 aa  256  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  59.57 
 
 		 148 aa  189  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  57.55 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  59.57 
 
 		 148 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  56.64 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  54.61 
 
 		 160 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  54.61 
 
 		 160 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  53.9 
 
 		 160 aa  173  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  50.81 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  42.47 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  41.55 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  38.03 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  36.69 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  36.69 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  38.17 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  39.02 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  37.21 
 
 		 301 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  40.98 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 304 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  37.1 
 
 		 295 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  36.97 
 
 		 319 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  34.15 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  24.69 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  26.12 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  26.67 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  27.69 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  27.41 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  25.2 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 		 233 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  25.19 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  24.82 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  24.82 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  25.2 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  26.67 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  23.81 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  26.92 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  26.15 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  24.44 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  28.71 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  26.83 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  18.18 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  23.48 
 
 		 135 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  24.44 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  24.41 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  27.94 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  22.89 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  27.94 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  27.94 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  24 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  27.27 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  24.3 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  29.57 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  23.88 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  22.63 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  20.78 
 
 		 156 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  22.06 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  25.21 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  25.58 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  26.87 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  26.87 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  24.42 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  26.87 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>