85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1624 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 150 aa  310  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  74.13 
 
 		 148 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  74.83 
 
 		 160 aa  230  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  74.15 
 
 		 160 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  74.15 
 
 		 160 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  72.37 
 
 		 160 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  69.44 
 
 		 148 aa  226  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  70.63 
 
 		 148 aa  225  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  55.63 
 
 		 334 aa  180  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 332 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  55.78 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  55.8 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  55.63 
 
 		 159 aa  178  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 168 aa  178  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 165 aa  176  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 165 aa  176  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 165 aa  176  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  55.63 
 
 		 335 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  54.23 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  54.23 
 
 		 329 aa  170  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  40.43 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  51.22 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  42.54 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  42.47 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 		 168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 		 168 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  41.73 
 
 		 168 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  39.44 
 
 		 172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 		 167 aa  106  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  44.54 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  41.55 
 
 		 167 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  38.35 
 
 		 163 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  37.59 
 
 		 295 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  38.21 
 
 		 304 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  35.82 
 
 		 301 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  37.4 
 
 		 319 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  33.87 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  34.92 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  27.91 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  28.35 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  24.03 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  24.03 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  21.43 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  26.61 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  32.29 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  29.17 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  25.45 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  31.68 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  26.92 
 
 		 178 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  28.33 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  30.58 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  26.23 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 154 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  29.29 
 
 		 162 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  28.36 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  25.71 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  26.79 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  25.41 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  26.87 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  26.87 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  26.87 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  24.11 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  25.41 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  25.6 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  25.41 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  25.41 
 
 		 175 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  25.44 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>