105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2323 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 147 aa  306  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  95.1 
 
 		 155 aa  289  9e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  84.25 
 
 		 159 aa  269  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  83.92 
 
 		 332 aa  266  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  84.62 
 
 		 154 aa  266  7e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  84.62 
 
 		 154 aa  266  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  84.62 
 
 		 154 aa  266  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  80.27 
 
 		 165 aa  263  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  80.27 
 
 		 165 aa  263  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  80.27 
 
 		 165 aa  263  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  82.19 
 
 		 334 aa  263  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  80.27 
 
 		 165 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  81.51 
 
 		 168 aa  263  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  79.59 
 
 		 335 aa  261  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  81.82 
 
 		 154 aa  256  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  77.62 
 
 		 329 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  56.83 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  57.93 
 
 		 148 aa  186  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  57.93 
 
 		 148 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  56.55 
 
 		 148 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  57.75 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  56.74 
 
 		 160 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  56.74 
 
 		 160 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  55.78 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  50.81 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  43.41 
 
 		 145 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  39.72 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  39.01 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  38.03 
 
 		 172 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  39.01 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  39.84 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  36.64 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  36.43 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  36.43 
 
 		 301 aa  95.9  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 		 304 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  37.7 
 
 		 295 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  33.82 
 
 		 319 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  34.68 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  25.9 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  29.37 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  25.37 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  25.2 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  26.12 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  29.73 
 
 		 157 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  25.19 
 
 		 162 aa  52  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  27.69 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  24.6 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  26.36 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  27.78 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  24.44 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  24.06 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  26.12 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  28.71 
 
 		 144 aa  48.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  25.2 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  24.41 
 
 		 178 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  23.7 
 
 		 188 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  28.68 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  28.68 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  28.68 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  17.42 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 		 233 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  24.63 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  28.72 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  22.08 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  25.93 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  25.93 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  31.58 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  25.93 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  25.93 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  25.93 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  25.93 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  25.74 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  24 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  25.93 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  22.96 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  25.93 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  22.73 
 
 		 160 aa  42.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  28.72 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  25.21 
 
 		 169 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  22.73 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 		 158 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  26.6 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  23.77 
 
 		 167 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>