153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3469 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  80.36 
 
 		 169 aa  274  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  77.92 
 
 		 162 aa  249  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  74.84 
 
 		 160 aa  234  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  74.84 
 
 		 160 aa  233  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  70.06 
 
 		 166 aa  228  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  68.71 
 
 		 163 aa  219  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  51.57 
 
 		 162 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  42.24 
 
 		 163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  38.61 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  41.82 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  40.61 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  39.13 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  38.26 
 
 		 154 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  37.58 
 
 		 154 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  38.26 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  38.26 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  38.26 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  36.25 
 
 		 162 aa  101  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  38.93 
 
 		 154 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  38.93 
 
 		 154 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  38.93 
 
 		 154 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  38.26 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  38.41 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  40.58 
 
 		 154 aa  98.6  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  39.86 
 
 		 154 aa  97.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  34.9 
 
 		 154 aa  95.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  34.9 
 
 		 154 aa  95.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  36.24 
 
 		 154 aa  94.4  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  37.68 
 
 		 154 aa  94  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  35.53 
 
 		 156 aa  94  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  41.13 
 
 		 156 aa  92  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  39.69 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  39.69 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  39.69 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  33.99 
 
 		 157 aa  88.2  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  34.29 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  34.29 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  34.29 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  34.29 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  34.29 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  32.86 
 
 		 155 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 		 155 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  32.86 
 
 		 155 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  32.86 
 
 		 155 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  32.86 
 
 		 161 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  32.86 
 
 		 155 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  32.86 
 
 		 155 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  32.86 
 
 		 161 aa  84.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  32.86 
 
 		 161 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  36.43 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  32.8 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 168 aa  62  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  33.08 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  61.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  32.54 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  32.54 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  32.54 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  35.04 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  30.83 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  32.8 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  32.28 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  32 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  31.11 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  29.01 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  27.52 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  23.48 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  29.32 
 
 		 136 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 332 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  30.37 
 
 		 334 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  29.17 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 140 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 136 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 155 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  24.82 
 
 		 155 aa  52  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 		 154 aa  51.6  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  34.78 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  27.5 
 
 		 301 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  28.99 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  38.1 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  28.72 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  28.33 
 
 		 139 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  29.86 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  27.69 
 
 		 138 aa  48.5  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>