142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1884 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 332 aa  690    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  85.37 
 
 		 334 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  78.57 
 
 		 335 aa  557  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  75.08 
 
 		 329 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  83.53 
 
 		 175 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  83.53 
 
 		 175 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  83.53 
 
 		 175 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  82.94 
 
 		 175 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  85.89 
 
 		 165 aa  299  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  81.18 
 
 		 175 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  81.18 
 
 		 175 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  81.18 
 
 		 175 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  81.18 
 
 		 175 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  80.25 
 
 		 169 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  78.4 
 
 		 180 aa  286  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  90.28 
 
 		 168 aa  278  7e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  88.81 
 
 		 159 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  88.11 
 
 		 154 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  88.11 
 
 		 154 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  88.11 
 
 		 154 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  77.25 
 
 		 165 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  86.01 
 
 		 165 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  86.01 
 
 		 165 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  86.01 
 
 		 165 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  77.3 
 
 		 168 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  82.99 
 
 		 155 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  83.92 
 
 		 147 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  85.31 
 
 		 154 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  58.27 
 
 		 144 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  57.45 
 
 		 148 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  57.45 
 
 		 148 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  54.17 
 
 		 148 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  56.55 
 
 		 160 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  55.32 
 
 		 160 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  55.32 
 
 		 160 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  55.32 
 
 		 160 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 150 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  35.08 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  33.23 
 
 		 319 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  32.91 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  52.35 
 
 		 156 aa  159  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  52.14 
 
 		 157 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  49.35 
 
 		 157 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  33.66 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  47.13 
 
 		 178 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 		 159 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  45.14 
 
 		 158 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  45.14 
 
 		 158 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  45.14 
 
 		 158 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  45.14 
 
 		 158 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  51.2 
 
 		 150 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 139 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  40.79 
 
 		 167 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  38.04 
 
 		 168 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 173 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 		 144 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 		 152 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 168 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  42.97 
 
 		 145 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  41.13 
 
 		 168 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  38.03 
 
 		 172 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  37.18 
 
 		 167 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  39.46 
 
 		 233 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  47.15 
 
 		 167 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  40.91 
 
 		 163 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  36.3 
 
 		 163 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  40.15 
 
 		 163 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  40.65 
 
 		 141 aa  109  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  35.29 
 
 		 163 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  47.11 
 
 		 158 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  40.6 
 
 		 167 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  41.32 
 
 		 152 aa  106  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  40.6 
 
 		 144 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  40.31 
 
 		 151 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  37.31 
 
 		 140 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  41.48 
 
 		 155 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  37.19 
 
 		 167 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 128 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  87  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  35.77 
 
 		 137 aa  77  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  41.46 
 
 		 150 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  31.85 
 
 		 168 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  33 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  31.85 
 
 		 161 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  26.47 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  29.81 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  32.11 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 155 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 138 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  30.4 
 
 		 169 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  29.6 
 
 		 188 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  30.88 
 
 		 166 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  35.06 
 
 		 154 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  28.36 
 
 		 163 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  26.45 
 
 		 138 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  26.12 
 
 		 162 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  23.85 
 
 		 135 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.47 
 
 		 126 aa  49.7  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  26.97 
 
 		 156 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>