64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0905 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 167 aa  342  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  51.52 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  50 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  37.31 
 
 		 329 aa  101  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  39.83 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  35.82 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  37.1 
 
 		 169 aa  98.2  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  41.53 
 
 		 163 aa  97.1  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  41.53 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  38.57 
 
 		 233 aa  97.1  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  39.23 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  37.19 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 		 332 aa  95.1  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  35.54 
 
 		 178 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  37.1 
 
 		 175 aa  94  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 175 aa  94  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 175 aa  94  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 175 aa  94  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 175 aa  94  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  37.1 
 
 		 335 aa  93.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  35.54 
 
 		 334 aa  93.2  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  35.54 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  39.83 
 
 		 144 aa  93.2  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  37.1 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  37.1 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  37.1 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  38.36 
 
 		 301 aa  92  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  39.52 
 
 		 295 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  31.65 
 
 		 157 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  36.23 
 
 		 319 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 		 304 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  42.06 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  30.3 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  33.06 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  31.96 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  32.91 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  32.99 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  31.33 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  28.72 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  24.18 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  27.84 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  26.79 
 
 		 135 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 135 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  28.43 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  29.13 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  28.7 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  26.4 
 
 		 129 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>