144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2754 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  699    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  85.37 
 
 		 332 aa  592  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  79.65 
 
 		 335 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  73.95 
 
 		 329 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  86.67 
 
 		 175 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  86.06 
 
 		 175 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  86.06 
 
 		 175 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  85.45 
 
 		 175 aa  301  9e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  85.37 
 
 		 165 aa  300  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  82.63 
 
 		 175 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  82.63 
 
 		 175 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  82.63 
 
 		 175 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  82.63 
 
 		 175 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  78.31 
 
 		 180 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  80.37 
 
 		 169 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  81.65 
 
 		 159 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  85.81 
 
 		 168 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  78.26 
 
 		 165 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  78.26 
 
 		 165 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  78.26 
 
 		 165 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  78.26 
 
 		 165 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  82.67 
 
 		 154 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  81.58 
 
 		 154 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  81.58 
 
 		 154 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  81.58 
 
 		 154 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  75 
 
 		 168 aa  264  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  82.19 
 
 		 147 aa  263  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  81.82 
 
 		 155 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  58.27 
 
 		 144 aa  192  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  58.16 
 
 		 148 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  57.45 
 
 		 148 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  57.04 
 
 		 160 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 		 148 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 160 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 160 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 		 160 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 		 150 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  34.31 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  53.74 
 
 		 156 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  32.7 
 
 		 295 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  50.64 
 
 		 157 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  53.57 
 
 		 157 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  33.23 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  35.17 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  51.11 
 
 		 159 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  45.86 
 
 		 178 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  42.5 
 
 		 158 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 158 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 158 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  52.07 
 
 		 150 aa  136  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 158 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  49.19 
 
 		 139 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  40.82 
 
 		 167 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  38.73 
 
 		 144 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  40.69 
 
 		 152 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  44.9 
 
 		 167 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  42.97 
 
 		 145 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  37.42 
 
 		 168 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  36.77 
 
 		 168 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  36.77 
 
 		 168 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  37.18 
 
 		 167 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  35.9 
 
 		 172 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  40.15 
 
 		 163 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  39.39 
 
 		 163 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  41.35 
 
 		 144 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  41.35 
 
 		 167 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  43.8 
 
 		 152 aa  109  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  41.09 
 
 		 151 aa  109  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  40.65 
 
 		 141 aa  108  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  35.29 
 
 		 163 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  35.71 
 
 		 163 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  37.31 
 
 		 140 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  39.31 
 
 		 155 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  42.15 
 
 		 158 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  35.54 
 
 		 167 aa  93.2  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  38.97 
 
 		 162 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 128 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  35.77 
 
 		 137 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  40.45 
 
 		 162 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  41.46 
 
 		 150 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  31.85 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  31.11 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  28.68 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  26.87 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  31.13 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  27.91 
 
 		 157 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 		 138 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  30.6 
 
 		 166 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  25.38 
 
 		 135 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  30.37 
 
 		 188 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 154 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.47 
 
 		 126 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  26.45 
 
 		 138 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  28.8 
 
 		 169 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  26.32 
 
 		 156 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  28.36 
 
 		 163 aa  50.4  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  32.89 
 
 		 151 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>