251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4895 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
167 aa  341  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  48.98 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  52.34 
 
 
152 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  52.27 
 
 
151 aa  134  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  49.62 
 
 
140 aa  130  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  50.7 
 
 
304 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  54.62 
 
 
319 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  49.26 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  49.65 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  47.89 
 
 
295 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  46.62 
 
 
335 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  49.62 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  50.41 
 
 
180 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  57.28 
 
 
301 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  49.62 
 
 
163 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  48.78 
 
 
175 aa  124  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 
175 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  48.78 
 
 
165 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  48.78 
 
 
175 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 
175 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  49.59 
 
 
329 aa  123  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 
175 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 
175 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  48.78 
 
 
175 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  48.78 
 
 
175 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  44.9 
 
 
334 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  48.85 
 
 
144 aa  121  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  45.86 
 
 
168 aa  120  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  48.78 
 
 
169 aa  120  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  49.11 
 
 
159 aa  117  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  47.15 
 
 
332 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  44.7 
 
 
156 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  45.16 
 
 
158 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  45.16 
 
 
158 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  46.09 
 
 
157 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  46.38 
 
 
158 aa  114  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  43.55 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  45.83 
 
 
157 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  43.7 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  48.33 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  43.44 
 
 
158 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  42.75 
 
 
155 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  43.48 
 
 
167 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  33.81 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  31.97 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  30.37 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  29.63 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  32.03 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
150 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  31.2 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  30.95 
 
 
148 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
139 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
144 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  32.41 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
134 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
148 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  32.41 
 
 
134 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  32.41 
 
 
134 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
145 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  34.52 
 
 
155 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  31.43 
 
 
144 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  26.09 
 
 
135 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
134 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  29.63 
 
 
134 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
139 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  29.63 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  30.48 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  29.63 
 
 
135 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  27.69 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  26.72 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  26.32 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  26.97 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  26.97 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  26.32 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  26.97 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  26.97 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  26.32 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  26.97 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  26.97 
 
 
155 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
150 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  29.41 
 
 
154 aa  51.2  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.72 
 
 
153 aa  51.2  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  26.32 
 
 
155 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
155 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  26.32 
 
 
155 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  26.32 
 
 
155 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  26.32 
 
 
155 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  26.32 
 
 
155 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
154 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
154 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  26.32 
 
 
161 aa  51.2  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 
154 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  26.32 
 
 
161 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
225 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>