199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0216 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  319  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  319  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  319  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  74.36 
 
 		 156 aa  245  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  67.55 
 
 		 161 aa  224  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  66.89 
 
 		 155 aa  223  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  66.89 
 
 		 155 aa  223  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  66.89 
 
 		 155 aa  223  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  66.89 
 
 		 155 aa  223  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  66.89 
 
 		 155 aa  223  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  66.89 
 
 		 155 aa  223  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  66.89 
 
 		 161 aa  223  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  66.89 
 
 		 161 aa  223  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  66.67 
 
 		 155 aa  223  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  66.89 
 
 		 155 aa  220  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  66.89 
 
 		 155 aa  220  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  66.89 
 
 		 155 aa  220  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  66.89 
 
 		 155 aa  220  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  66.89 
 
 		 155 aa  220  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  64.74 
 
 		 156 aa  210  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  64.71 
 
 		 162 aa  209  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  64.9 
 
 		 162 aa  207  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0240  hypothetical protein  58.28 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.368257  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  48.59 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  46.1 
 
 		 154 aa  146  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  46.71 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  46.71 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  46.71 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  46.41 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  46.41 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  46.41 
 
 		 154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  46.71 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  44.81 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  46.41 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  47.3 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3823  hypothetical protein  45.21 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  45.1 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  45.77 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  46.36 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  43.79 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  44.59 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  41.45 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  41.01 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  39.57 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  39.57 
 
 		 160 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  39.69 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  39.69 
 
 		 188 aa  90.5  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  36.69 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  37.4 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0435  hypothetical protein  33.81 
 
 		 163 aa  84.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0158268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  37.93 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  30.14 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  30.46 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  32.87 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  32.87 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  30.52 
 
 		 295 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  24.14 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  28.06 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  25 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  32.88 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  31.15 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  36.94 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 304 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  32.45 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  27.01 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  29.8 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  26.72 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  29.84 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  27.69 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  29.37 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  25.9 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  25.18 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  27.97 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  26.76 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  27.78 
 
 		 329 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  27.87 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  29.2 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  29.5 
 
 		 335 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>