295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3101 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
162 aa  328  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  53.47 
 
 
153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  50.68 
 
 
155 aa  156  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  51.41 
 
 
148 aa  154  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  52.05 
 
 
153 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  46.58 
 
 
146 aa  147  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  47.18 
 
 
148 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  52.76 
 
 
132 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  47.33 
 
 
159 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  50.79 
 
 
129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  47.48 
 
 
151 aa  134  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  43.42 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  42.95 
 
 
185 aa  128  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  44.29 
 
 
151 aa  127  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  44.29 
 
 
151 aa  127  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  45.8 
 
 
136 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  47.18 
 
 
155 aa  120  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  49.64 
 
 
147 aa  121  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  41.22 
 
 
154 aa  117  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  39.71 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  39.71 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  47.54 
 
 
155 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  37.59 
 
 
145 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  37.75 
 
 
169 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  46.96 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  45.08 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  49.15 
 
 
124 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  44.92 
 
 
142 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  44.92 
 
 
138 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  43.75 
 
 
158 aa  97.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
213 aa  91.3  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  41.91 
 
 
136 aa  85.5  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  37.74 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  31.39 
 
 
138 aa  77  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  36.5 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  39.5 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  37.98 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  37.12 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  35.61 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  32.8 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  32.8 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  32.8 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  32.8 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  34.09 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.28 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.84 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  30.6 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  37.17 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  37.17 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  37.17 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  37.17 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  37.17 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  37.17 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  28.85 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  37.17 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  37.17 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  33.07 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  32.71 
 
 
145 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 
139 aa  60.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 
147 aa  60.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  34.88 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  33.61 
 
 
238 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  37.14 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  35.51 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  37.14 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  32.8 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  32.8 
 
 
177 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  32.8 
 
 
177 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  32.8 
 
 
177 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  33.61 
 
 
248 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  32.8 
 
 
374 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
176 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  32.74 
 
 
141 aa  57.8  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  31.93 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  27.41 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  30.83 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  29.46 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  31.13 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.33 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  35.79 
 
 
147 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  35.85 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 
131 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>